Protein–RNA interactions for Protein: O15444

CCL25, C-C motif chemokine 25, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL25O15444 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL25O15444 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL25O15444 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL25O15444 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL25O15444 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL25O15444 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL25O15444 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL25O15444 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL25O15444 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL25O15444 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL25O15444 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL25O15444 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL25O15444 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL25O15444 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL25O15444 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL25O15444 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL25O15444 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL25O15444 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL25O15444 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL25O15444 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL25O15444 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL25O15444 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL25O15444 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL25O15444 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL25O15444 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL25O15444 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL25O15444 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL25O15444 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL25O15444 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL25O15444 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL25O15444 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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CCL25O15444 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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CCL25O15444 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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CCL25O15444 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL25O15444 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL25O15444 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL25O15444 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL25O15444 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL25O15444 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL25O15444 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL25O15444 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL25O15444 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL25O15444 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL25O15444 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms