Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1BO15143 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms