Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms