Protein–RNA interactions for Protein: A6NKX1

FAM223B, Protein FAM223B, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM223BA6NKX1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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FAM223BA6NKX1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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