Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms