Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRELID3BQ9Y3B1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms