Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms