Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms