Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms