Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms