Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC2Q9Y235 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms