Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms