Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
ZNF608Q9ULD9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ZNF608Q9ULD9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ZNF608Q9ULD9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
ZNF608Q9ULD9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ZNF608Q9ULD9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ZNF608Q9ULD9 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ZNF608Q9ULD9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ZNF608Q9ULD9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms