Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms