Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms