Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK97

FBXO9, F-box only protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO9Q9UK97 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms