Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW8

ZNF180, Zinc finger protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF180Q9UJW8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF180Q9UJW8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms