Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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