Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS29Q9UBQ0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS29Q9UBQ0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS29Q9UBQ0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS29Q9UBQ0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS29Q9UBQ0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS29Q9UBQ0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS29Q9UBQ0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS29Q9UBQ0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS29Q9UBQ0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS29Q9UBQ0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms