Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFIP11Q9UBB9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms