Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN3Q9P232 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms