Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms