Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms