Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX00

TMEM160, Transmembrane protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM160Q9NX00 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM160Q9NX00 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms