Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV44

LINC00846, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00846, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00846Q9NV44 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00846Q9NV44 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms