Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRH2

SNRK, SNF-related serine/threonine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRKQ9NRH2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRKQ9NRH2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms