Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms