Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms