Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms