Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
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