Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GPR88Q9GZN0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms