Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC39A8Q9C0K1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC39A8Q9C0K1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms