Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms