Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSD3Q9BZ95 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms