Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms