Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms