Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms