Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms