Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms