Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC17Q96LX7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC17Q96LX7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC17Q96LX7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC17Q96LX7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC17Q96LX7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC17Q96LX7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC17Q96LX7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC17Q96LX7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC17Q96LX7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC17Q96LX7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC17Q96LX7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC17Q96LX7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC17Q96LX7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC17Q96LX7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC17Q96LX7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms