Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms