Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNX27Q96L92 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms