Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms