Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF428Q96B54 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms