Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRIM63Q969Q1 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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TRIM63Q969Q1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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TRIM63Q969Q1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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TRIM63Q969Q1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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TRIM63Q969Q1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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