Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms