Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms