Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms