Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms