Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms